Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCBP3Q53F19 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCBP3Q53F19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms