Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP55Q53EZ4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms