Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A12Q504Y0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms