Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
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