Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRY2Q49AN0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms