Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms