Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms