Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UVSSAQ2YD98 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UVSSAQ2YD98 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms