Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM71Q2Q1W2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms