Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTC4SQ16873 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms