Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP1Q16831 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms