Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIST2H2BEQ16778 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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HIST2H2BEQ16778 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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HIST2H2BEQ16778 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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HIST2H2BEQ16778 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIST2H2BEQ16778 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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