Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALX1Q15699 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALX1Q15699 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
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