Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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