Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KARSQ15046 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KARSQ15046 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KARSQ15046 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KARSQ15046 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KARSQ15046 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KARSQ15046 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KARSQ15046 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KARSQ15046 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KARSQ15046 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KARSQ15046 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KARSQ15046 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KARSQ15046 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KARSQ15046 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KARSQ15046 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KARSQ15046 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KARSQ15046 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KARSQ15046 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KARSQ15046 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KARSQ15046 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KARSQ15046 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KARSQ15046 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KARSQ15046 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KARSQ15046 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KARSQ15046 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KARSQ15046 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KARSQ15046 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KARSQ15046 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KARSQ15046 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KARSQ15046 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KARSQ15046 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KARSQ15046 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KARSQ15046 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KARSQ15046 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KARSQ15046 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KARSQ15046 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KARSQ15046 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KARSQ15046 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KARSQ15046 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KARSQ15046 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KARSQ15046 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KARSQ15046 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KARSQ15046 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KARSQ15046 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KARSQ15046 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KARSQ15046 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
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