Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARB2Q14108 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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