Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNGB1Q14028 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
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