Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA9Q13797 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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