Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOFQ13790 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOFQ13790 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOFQ13790 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOFQ13790 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOFQ13790 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOFQ13790 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOFQ13790 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOFQ13790 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOFQ13790 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOFQ13790 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOFQ13790 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOFQ13790 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOFQ13790 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOFQ13790 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOFQ13790 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOFQ13790 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOFQ13790 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOFQ13790 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOFQ13790 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOFQ13790 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOFQ13790 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOFQ13790 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APOFQ13790 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APOFQ13790 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOFQ13790 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOFQ13790 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOFQ13790 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOFQ13790 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOFQ13790 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOFQ13790 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOFQ13790 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOFQ13790 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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