Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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