Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB3BPQ13352 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms