Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATMQ13315 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATMQ13315 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATMQ13315 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATMQ13315 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATMQ13315 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATMQ13315 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATMQ13315 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATMQ13315 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATMQ13315 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATMQ13315 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATMQ13315 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATMQ13315 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATMQ13315 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATMQ13315 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATMQ13315 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATMQ13315 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATMQ13315 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATMQ13315 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATMQ13315 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATMQ13315 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATMQ13315 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATMQ13315 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATMQ13315 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATMQ13315 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATMQ13315 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATMQ13315 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATMQ13315 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATMQ13315 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATMQ13315 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATMQ13315 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATMQ13315 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATMQ13315 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATMQ13315 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATMQ13315 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATMQ13315 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATMQ13315 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATMQ13315 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATMQ13315 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATMQ13315 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATMQ13315 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATMQ13315 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATMQ13315 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATMQ13315 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATMQ13315 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATMQ13315 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATMQ13315 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATMQ13315 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATMQ13315 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATMQ13315 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATMQ13315 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATMQ13315 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATMQ13315 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATMQ13315 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATMQ13315 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATMQ13315 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATMQ13315 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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