Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms