Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ERCC8Q13216 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ERCC8Q13216 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ERCC8Q13216 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ERCC8Q13216 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ERCC8Q13216 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ERCC8Q13216 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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ERCC8Q13216 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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