Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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