Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms