Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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