Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 MSW1YDR268W 1140 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 MAM1YER106W 909 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 BCY1YIL033C 1251 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 RNR2YJL026W 1200 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 ATG5YPL149W 885 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YFR006WYFR006W 1608 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 WHI2YOR043W 1461 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 KKQ8YKL168C 2175 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 RRN7YJL025W 1545 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 RPN11YFR004W 921 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YGR127WYGR127W 939 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 MPC2YHR162W 390 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 THP2YHR167W 786 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 BET1YIL004C 429 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 BET3YKR068C 582 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YLR400WYLR400W 474 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 MFM1YPL060W 1242 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 PPT2YPL148C 522 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 KEX2YNL238W 2445 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 FAR10YLR238W 1437 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 FRS2YFL022C 1512 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 AEP2YMR282C 1743 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 BSC1YDL037C 987 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 MND1YGL183C 660 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 THG1YGR024C 714 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YGR045CYGR045C 363 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 PET130YJL023C 1044 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YKR073CYKR073C 321 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 GIM3YNL153C 390 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 ATX2YOR079C 942 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 NIP7YPL211W 546 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 DCC1YCL016C 1143 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 GGA1YDR358W 1674 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 SIT1YEL065W 1887 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YMR279CYMR279C 1623 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 MKC7YDR144C 1791 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 MAL12YGR292W 1755 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 MAL32YBR299W 1755 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 UBC9YDL064W 474 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 SDH4YDR178W 546 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 RSM18YER050C 417 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YER158W-AYER158W-A 216 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 RPT6YGL048C 1218 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 THI4YGR144W 981 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 SEC22YLR268W 645 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 ETR1YBR026C 1143 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 CBP3YPL215W 1008 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 MLC2YPR188C 492 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YBR096WYBR096W 693 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 RPB5YBR154C 648 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 EMP47YFL048C 1338 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 AMA1YGR225W 1782 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 PRP31YGR091W 1485 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 FBP26YJL155C 1359 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 PTK2YJR059W 2457 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YDR391CYDR391C 699 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YKL153WYKL153W 510 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YLR317WYLR317W 435 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 FMP41YNL168C 780 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 CAF20YOR276W 486 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YOR366WYOR366W 354 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 ALG2YGL065C 1512 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 CLB1YGR108W 1416 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 PHO5YBR093C 1404 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YLL067CYLL067C 3618 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 LDB19YOR322C 2457 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 MSN4YKL062W 1893 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YER010CYER010C 705 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 MIG3YER028C 1185 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YGR018CYGR018C 330 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 RME1YGR044C 903 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YKL063CYKL063C 504 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 RPS0BYLR048W 759 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 TSA1YML028W 591 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 GIM5YML094W 492 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 TSR4YOL022C 1227 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 ILV6YCL009C 930 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 THI22YPR121W 1719 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 HIR1YBL008W 2523 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 NGR1YBR212W 2019 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 VMA21YGR105W 234 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 DSE2YHR143W 978 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YNK1YKL067W 462 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 VPH2YKL119C 648 nt5.45□□□□□ -1.54
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