Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 ARO4YBR249C 1113 nt5□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 NHP10YDL002C 612 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 PIR1YKL164C 1026 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 MOT2YER068W 1764 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 KIC1YHR102W 3243 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 MRPS35YGR165W 1038 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 NUP60YAR002W 1620 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 VMA1YDL185W 3216 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 RTK1YDL025C 1863 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 RAD54YGL163C 2697 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 MRPL11YDL202W 750 nt4.96□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 RHO3YIL118W 696 nt4.96□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 GYP6YJL044C 1377 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 RRN7YJL025W 1545 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 PHM8YER037W 966 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 RPL30YGL030W 318 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 CFD1YIL003W 882 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 TPM1YNL079C 600 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 RRG9YNL213C 645 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 DNM1YLL001W 2274 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 CAF120YNL278W 3183 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 SRO7YPR032W 3102 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 NUS1YDL193W 1128 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 RPS8BYER102W 603 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 YMR087WYMR087W 855 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 RPS8AYBL072C 603 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 CHO2YGR157W 2610 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 KRE5YOR336W 4098 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 PRE8YML092C 753 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 THR4YCR053W 1545 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 YGR125WYGR125W 3111 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 TLG1YDR468C 675 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 GRX4YER174C 735 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 SHG1YBR258C 429 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 MLH2YLR035C 2088 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 TAH18YPR048W 1872 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 IMD4YML056C 1575 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 TGL3YMR313C 1929 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 SYF1YDR416W 2580 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 YME2YMR302C 2553 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 NMA111YNL123W 2994 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 VPS21YOR089C 633 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 AUR1YKL004W 1206 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 CUE3YGL110C 1875 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1B-GR3Q12316 UBP5YER144C 2418 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 EMW1YNL313C 2715 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 CLD1YGR110W 1338 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 ERG26YGL001C 1050 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 SED5YLR026C 1023 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 YAR069CYAR069C 294 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 NCE103YNL036W 666 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 OXR1YPL196W 822 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 NHX1YDR456W 1902 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 MDR1YGR100W 2853 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 VID28YIL017C 2766 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 SOP4YJL192C 705 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 MET7YOR241W 1647 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 PCI8YIL071C 1335 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 NFT1YKR103W 3657 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 GSC2YGR032W 5688 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 RFM1YOR279C 933 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 DPB2YPR175W 2070 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 TAF7YMR227C 1773 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 DOG2YHR043C 741 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 YBL108WYBL108W 306 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 SUI3YPL237W 858 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 PMC1YGL006W 3522 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 SIS2YKR072C 1689 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 DEG1YFL001W 1329 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 FMP30YPL103C 1407 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 TGS1YPL157W 948 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 NOC2YOR206W 2133 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 ACC1YNR016C 6702 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 YLR339CYLR339C 552 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 TPK2YPL203W 1143 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 TYW1YPL207W 2433 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 YJR030CYJR030C 2238 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 TMN2YDR107C 2019 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 PDR12YPL058C 4536 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 VHC1YBR235W 3363 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 GET1YGL020C 708 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 ENT3YJR125C 1227 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 YKL222CYKL222C 2118 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 NMD2YHR077C 3270 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 FRE8YLR047C 2061 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 TIR2YOR010C 756 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 RPO26YPR187W 468 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1B-GR3Q12316 HCA4YJL033W 2313 nt4.84□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 YLH47YPR125W 1365 nt4.84□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 LPP1YDR503C 825 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 CDC21YOR074C 915 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 DHR2YKL078W 2208 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 YFR006WYFR006W 1608 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 MPA43YNL249C 1629 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 RPB2YOR151C 3675 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 YOR331CYOR331C 558 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 SEC27YGL137W 2670 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 VBA2YBR293W 1425 nt4.82□□□□□ -1.64
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