Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 RSM10YDR041W 612 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 NKP1YDR383C 717 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 GAL83YER027C 1254 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 SHO1YER118C 1104 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 CAF16YFL028C 870 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 YKL153WYKL153W 510 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 SCW10YMR305C 1170 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 RPL43AYPR043W 279 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 MSS18YPR134W 807 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 snR41snR41 95 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 FYV5YCL058C 459 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 PRP3YDR473C 1410 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 MAL31YBR298C 1845 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 YMR034CYMR034C 1305 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 ERR1YOR393W 1314 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 ERR2YPL281C 1314 nt7.5□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 FKH1YIL131C 1455 nt7.49□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 CDC23YHR166C 1881 nt7.49□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 YGR127WYGR127W 939 nt7.49□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 POR2YIL114C 846 nt7.49□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 SQT1YIR012W 1296 nt7.49□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 YLR171WYLR171W 390 nt7.49□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt7.49□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 PHO80YOL001W 882 nt7.49□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 RIB4YOL143C 510 nt7.49□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 LSC1YOR142W 990 nt7.49□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 SPP381YBR152W 876 nt7.49□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 RPN3YER021W 1572 nt7.49□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 SPO1YNL012W 1896 nt7.49□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 ATE1YGL017W 1512 nt7.48□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 SDH6YDR379C-A 240 nt7.48□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 HPT1YDR399W 666 nt7.48□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 AST2YER101C 1293 nt7.48□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 RPT6YGL048C 1218 nt7.48□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 BUD32YGR262C 786 nt7.48□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 COS3YML132W 1140 nt7.48□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 SCS22YBL091C-A 528 nt7.48□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 YOR053WYOR053W 342 nt7.48□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 YOR277CYOR277C 309 nt7.48□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 COS2YBR302C 1140 nt7.48□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 MIC60YKR016W 1623 nt7.48□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 MSC3YLR219W 2187 nt7.47□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 RBS1YDL189W 1374 nt7.47□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 GPD1YDL022W 1176 nt7.47□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt7.47□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 LCL3YGL085W 825 nt7.47□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 RAD33YML011C 534 nt7.47□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 YBR113WYBR113W 483 nt7.47□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 ICP55YER078C 1536 nt7.47□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 MAD3YJL013C 1548 nt7.47□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 GUS1YGL245W 2127 nt7.46□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 AQR1YNL065W 1761 nt7.46□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 SNU66YOR308C 1764 nt7.46□□□□□ -1.21
NCR1Q12200 IZH1YDR492W 951 nt7.46□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.46□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 SPT15YER148W 723 nt7.46□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 FAR7YFR008W 666 nt7.46□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 EMG1YLR186W 759 nt7.46□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 FOL3YMR113W 1284 nt7.46□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 ANT1YPR128C 987 nt7.46□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 PRP31YGR091W 1485 nt7.46□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 NUP84YDL116W 2181 nt7.46□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 HXT13YEL069C 1695 nt7.45□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YGL176CYGL176C 1665 nt7.45□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 THI20YOL055C 1656 nt7.45□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 TMA20YER007C-A 546 nt7.45□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 FAU1YER183C 636 nt7.45□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt7.45□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 GTO3YMR251W 1101 nt7.45□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 CNL1YDR357C 369 nt7.44□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 MAG1YER142C 891 nt7.44□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 THR1YHR025W 1074 nt7.44□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 REC107YJR021C 945 nt7.44□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 MDE1YJR024C 735 nt7.44□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YLR224WYLR224W 1110 nt7.44□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 RPC19YNL113W 429 nt7.44□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 RPC34YNR003C 954 nt7.44□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 ILV6YCL009C 930 nt7.44□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 HBN1YCL026C-B 582 nt7.44□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 GPD2YOL059W 1323 nt7.44□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 FCY2YER056C 1602 nt7.44□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 TFG1YGR186W 2208 nt7.44□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 GYP8YFL027C 1494 nt7.43□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 AZR1YGR224W 1842 nt7.43□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YCL075WYCL075W 441 nt7.43□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 MRPS28YDR337W 861 nt7.43□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 ISD11YER048W-A 285 nt7.43□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 TDA2YER071C 381 nt7.43□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 RPL16AYIL133C 600 nt7.43□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YPT7YML001W 627 nt7.43□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 NIS1YNL078W 1224 nt7.43□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 MSL5YLR116W 1431 nt7.43□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 SLX5YDL013W 1860 nt7.43□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 CIT3YPR001W 1461 nt7.43□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 MHP1YJL042W 4197 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 BUD9YGR041W 1644 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YKR018CYKR018C 2178 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 AIM10YER087W 1731 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 FAD1YDL045C 921 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 SWF1YDR126W 1011 nt7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.1 ms