Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt4.38□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 ECM32YER176W 3366 nt4.38□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 CYK3YDL117W 2658 nt4.38□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 GAC1YOR178C 2382 nt4.38□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 MUM3YOR298W 1440 nt4.38□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 GSC2YGR032W 5688 nt4.37□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 SPS18YNL204C 903 nt4.37□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 YBR137WYBR137W 540 nt4.37□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 MEC3YLR288C 1425 nt4.37□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 KIC1YHR102W 3243 nt4.36□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 UBP7YIL156W 3216 nt4.36□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 COX23YHR116W 456 nt4.36□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 MTD1YKR080W 963 nt4.36□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt4.36□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 APC9YLR102C 798 nt4.36□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 VTA1YLR181C 993 nt4.36□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 YCF1YDR135C 4548 nt4.36□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 ACK1YDL203C 1872 nt4.36□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 STE23YLR389C 3084 nt4.36□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 SPO77YLR341W 1434 nt4.36□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 YDR444WYDR444W 2064 nt4.36□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 TRM1YDR120C 1713 nt4.35□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 NKP1YDR383C 717 nt4.35□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 SNM1YDR478W 597 nt4.35□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 OCA2YNL056W 594 nt4.35□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 MDJ2YNL328C 441 nt4.35□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 GSH2YOL049W 1476 nt4.35□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 IME4YGL192W 1803 nt4.35□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 LEU1YGL009C 2340 nt4.34□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 RPB2YOR151C 3675 nt4.34□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 NSA2YER126C 786 nt4.34□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 MAD2YJL030W 591 nt4.34□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 DXO1YDR370C 1329 nt4.34□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 YTA7YGR270W 4140 nt4.34□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 SIS2YKR072C 1689 nt4.34□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 MDR1YGR100W 2853 nt4.33□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 MDL1YLR188W 2088 nt4.33□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 CLD1YGR110W 1338 nt4.33□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 ARP10YDR106W 855 nt4.33□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt4.33□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt4.33□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 AUR1YKL004W 1206 nt4.33□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YLR012CYLR012C 300 nt4.33□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 SRN2YLR119W 642 nt4.33□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 CKA2YOR061W 1020 nt4.33□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 EXO1YOR033C 2109 nt4.33□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 AVT1YJR001W 1809 nt4.32□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 BUD27YFL023W 2391 nt4.32□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 HSP42YDR171W 1128 nt4.32□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 ERJ5YFR041C 888 nt4.32□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 MRPL16YBL038W 699 nt4.32□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 RPS9BYBR189W 588 nt4.32□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 FPK1YNR047W 2682 nt4.32□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 ECM16YMR128W 3804 nt4.32□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YTM1YOR272W 1383 nt4.31□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 VAC7YNL054W 3498 nt4.31□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 SAS10YDL153C 1833 nt4.31□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YGR011WYGR011W 327 nt4.31□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YPT7YML001W 627 nt4.31□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt4.31□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 MAD3YJL013C 1548 nt4.31□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 DIN7YDR263C 1293 nt4.3□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YJR085CYJR085C 318 nt4.3□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 ECM1YAL059W 639 nt4.3□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 UIP3YAR027W 708 nt4.3□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 CDC21YOR074C 915 nt4.3□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 HOM3YER052C 1584 nt4.3□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 ELM1YKL048C 1923 nt4.3□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 APE2YKL157W 2859 nt4.3□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 RPO21YDL140C 5202 nt4.3□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 VBA2YBR293W 1425 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 VAC8YEL013W 1737 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 IFM1YOL023W 2031 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YHR177WYHR177W 1362 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 DIP2YLR129W 2832 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 NHX1YDR456W 1902 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 GRX4YER174C 735 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 FMP48YGR052W 1110 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YGR107WYGR107W 450 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 PAU17YLL025W 375 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 COA4YLR218C 453 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 UTP23YOR004W 765 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 TIR2YOR010C 756 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YPL113CYPL113C 1191 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 PSE1YMR308C 3270 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 UBA2YDR390C 1911 nt4.29□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 PKH1YDR490C 2301 nt4.28□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YTA6YPL074W 2265 nt4.28□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 IXR1YKL032C 1794 nt4.28□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YER134CYER134C 537 nt4.28□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 CDC26YFR036W 375 nt4.28□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 SKI8YGL213C 1194 nt4.28□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YJL175WYJL175W 513 nt4.28□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YBL029WYBL029W 1131 nt4.28□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 RIM11YMR139W 1113 nt4.28□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 REG2YBR050C 1017 nt4.28□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt4.28□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt4.28□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt4.28□□□□□ -1.72
SLM3Q12093 HRK1YOR267C 2280 nt4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.6 ms