Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	HST1	YOL068C	1512 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	RAD57	YDR004W	1383 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	YOR022C	YOR022C	2148 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	GAC1	YOR178C	2382 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	NUS1	YDL193W	1128 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	MGR2	YPL098C	342 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	BDP1	YNL039W	1785 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	MLF3	YNL074C	1359 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	ZDS1	YMR273C	2748 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	XRS2	YDR369C	2565 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	MMS21	YEL019C	804 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	FRA2	YGL220W	363 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	CNB1	YKL190W	528 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	RRP40	YOL142W	723 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	ZRC1	YMR243C	1329 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	TRM11	YOL124C	1302 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	YPR003C	YPR003C	2265 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	DPH6	YLR143W	2058 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	SLM5	YCR024C	1479 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	APL4	YPR029C	2499 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	FLO10	YKR102W	3510 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	YER034W	YER034W	558 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	RFC2	YJR068W	1062 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	YLR154W-B	YLR154W-B	165 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	YBR056W-A	YBR056W-A	201 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	ELM1	YKL048C	1923 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	MTC4	YBR255W	2085 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	RIM4	YHL024W	2142 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	YGL140C	YGL140C	3660 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	PRP11	YDL043C	801 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	GON7	YJL184W	372 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	MMM1	YLL006W	1281 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	YLR402W	YLR402W	192 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	DSE3	YOR264W	1293 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	GCN5	YGR252W	1320 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	MNT4	YNR059W	1743 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	STU1	YBL034C	4542 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	DIN7	YDR263C	1293 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	PIC2	YER053C	903 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	YER147C-A	YER147C-A	411 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	REC104	YHR157W	549 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	RPS31	YLR167W	459 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	ELO3	YLR372W	1038 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	SNO1	YMR095C	675 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	SPC105	YGL093W	2754 nt		3.84	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	GGA1	YDR358W	1674 nt		3.84	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	TMN2	YDR107C	2019 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	GEP4	YHR100C	558 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	HMT1	YBR034C	1047 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	ECM16	YMR128W	3804 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	NUP159	YIL115C	4383 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	AIM21	YIR003W	2040 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	ALG9	YNL219C	1668 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	ALO1	YML086C	1581 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	HER2	YMR293C	1395 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YCR050C	YCR050C	309 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YER067C-A	YER067C-A	324 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	TIM21	YGR033C	720 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	PIR3	YKL163W	978 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	ARG80	YMR042W	534 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YOR379C	YOR379C	339 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	INA17	YPL099C	549 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YAR1	YPL239W	603 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YPL278C	YPL278C	303 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	NAT3	YPR131C	588 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	ERB1	YMR049C	2424 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YMR111C	YMR111C	1389 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	BCH2	YKR027W	2298 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	PHM6	YDR281C	315 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	MYO3	YKL129C	3819 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	NRK1	YNL129W	723 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	REG2	YBR050C	1017 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	snR17a	snR17a	333 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YPR015C	YPR015C	744 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	HPR1	YDR138W	2259 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	MPC54	YOR177C	1395 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YER085C	YER085C	522 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YHL026C	YHL026C	948 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	ATG33	YLR356W	594 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YMR105W-A	YMR105W-A	195 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	RPL18A	YOL120C	561 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	DSS4	YPR017C	432 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YDR444W	YDR444W	2064 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	GEM1	YAL048C	1989 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	RSC58	YLR033W	1509 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	ADY3	YDL239C	2373 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	OCT1	YKL134C	2319 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	LYP1	YNL268W	1836 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	MDL1	YLR188W	2088 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	GAS2	YLR343W	1668 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	TAF10	YDR167W	621 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	SEC53	YFL045C	765 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	ERV14	YGL054C	417 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	SPT4	YGR063C	309 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	CCS1	YMR038C	750 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	ASC1	YMR116C	960 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YBR016W	YBR016W	387 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	RER1	YCL001W	567 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YEH2	YLR020C	1617 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	RGP1	YDR137W	1992 nt		3.79	□□□□□ -1.8

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