Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms