Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms