Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms