Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms