Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms