Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	DUO1	YGL061C	744 nt		4.68	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	YJL218W	YJL218W	591 nt		4.68	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	THI11	YJR156C	1023 nt		4.68	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	YML116W-A	YML116W-A	303 nt		4.68	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	EOS1	YNL080C	1101 nt		4.68	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	YBL077W	YBL077W	432 nt		4.68	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	GIP4	YAL031C	2283 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	LAP3	YNL239W	1365 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	YSH1	YLR277C	2340 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	YHR032C-A	YHR032C-A	120 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	SNL1	YIL016W	480 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	YIR018C-A	YIR018C-A	138 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	YKL071W	YKL071W	771 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	YLR225C	YLR225C	1224 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	SEC72	YLR292C	582 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	TOM7	YNL070W	183 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	YPL025C	YPL025C	558 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	YPL114W	YPL114W	420 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	YBR134W	YBR134W	402 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	IKS1	YJL057C	2004 nt		4.67	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	HO	YDL227C	1761 nt		4.66	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	LSB1	YGR136W	726 nt		4.66	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	YIL163C	YIL163C	354 nt		4.66	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	EMG1	YLR186W	759 nt		4.66	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	MPD1	YOR288C	957 nt		4.66	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	XKS1	YGR194C	1803 nt		4.66	□□□□□ -1.66
MRD1	Q06106	AHA1	YDR214W	1053 nt		4.65	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YDR282C	YDR282C	1245 nt		4.65	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	SEM1	YDR363W-A	270 nt		4.65	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	SCL1	YGL011C	759 nt		4.65	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	MRM1	YOR201C	1239 nt		4.65	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	SLX1	YBR228W	915 nt		4.65	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	KIC1	YHR102W	3243 nt		4.65	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YOL153C	YOL153C	1746 nt		4.65	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	ALG9	YNL219C	1668 nt		4.64	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	PMT4	YJR143C	2289 nt		4.64	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	ARO9	YHR137W	1542 nt		4.64	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	BUD30	YDL151C	582 nt		4.64	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YGR079W	YGR079W	1113 nt		4.64	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YMR315W	YMR315W	1050 nt		4.64	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	DCS2	YOR173W	1062 nt		4.64	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	PEX30	YLR324W	1572 nt		4.64	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	FAR10	YLR238W	1437 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	BUD8	YLR353W	1812 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	ELO2	YCR034W	1044 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	CPR1	YDR155C	489 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	SPC19	YDR201W	498 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YFL041W-A	YFL041W-A	192 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YJR096W	YJR096W	849 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	SPC3	YLR066W	555 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	TDA5	YLR426W	981 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YOL024W	YOL024W	519 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	EFM2	YBR271W	1260 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	ABD1	YBR236C	1311 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	SEN1	YLR430W	6696 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	HOS3	YPL116W	2094 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	GAS4	YOL132W	1416 nt		4.63	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	MMT1	YMR177W	1533 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	CWC2	YDL209C	1020 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YGL152C	YGL152C	678 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	SAY1	YGR263C	1275 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	POL12	YBL035C	2118 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	THI7	YLR237W	1797 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	PUS9	YDL036C	1389 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	KIN4	YOR233W	2403 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	TRS85	YDR108W	2097 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	NUG1	YER006W	1563 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	RAD7	YJR052W	1698 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	CWH43	YCR017C	2862 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	MCP2	YLR253W	1710 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	IME4	YGL192W	1803 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YDL094C	YDL094C	510 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	RPB7	YDR404C	516 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	VPS71	YML041C	843 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	RDH54	YBR073W	2877 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YLR152C	YLR152C	1731 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	TOG1	YER184C	2385 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	CNN1	YFR046C	1086 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	RPL8A	YHL033C	771 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	FUR1	YHR128W	651 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	NDJ1	YOL104C	1059 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	TRM13	YOL125W	1431 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	RCM1	YNL022C	1473 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	PMC1	YGL006W	3522 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	AIM21	YIR003W	2040 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	TYW1	YPL207W	2433 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	HMG1	YML075C	3165 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YNR065C	YNR065C	3351 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YDL241W	YDL241W	372 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	DAS2	YDR020C	699 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	DIN7	YDR263C	1293 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YDR274C	YDR274C	372 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	NSE3	YDR288W	912 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	YGL199C	YGL199C	471 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	RPL14A	YKL006W	417 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	ISA1	YLL027W	753 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	MAP1	YLR244C	1164 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	PFA4	YOL003C	1137 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	CMR3	YPR013C	954 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MRD1	Q06106	EMP47	YFL048C	1338 nt		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.8 ms