Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms