Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A11Q02978 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms