Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOP2BQ02880 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOP2BQ02880 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOP2BQ02880 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOP2BQ02880 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOP2BQ02880 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2BQ02880 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2BQ02880 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2BQ02880 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2BQ02880 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2BQ02880 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2BQ02880 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
TOP2BQ02880 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
TOP2BQ02880 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2BQ02880 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms