Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNT1Q02742 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms