Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms