Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHDQ02161 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHDQ02161 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHDQ02161 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHDQ02161 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHDQ02161 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHDQ02161 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHDQ02161 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHDQ02161 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHDQ02161 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHDQ02161 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHDQ02161 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHDQ02161 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHDQ02161 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHDQ02161 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHDQ02161 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHDQ02161 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHDQ02161 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHDQ02161 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHDQ02161 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHDQ02161 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHDQ02161 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHDQ02161 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHDQ02161 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHDQ02161 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHDQ02161 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHDQ02161 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHDQ02161 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHDQ02161 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHDQ02161 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHDQ02161 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RHDQ02161 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHDQ02161 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHDQ02161 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHDQ02161 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHDQ02161 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHDQ02161 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHDQ02161 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHDQ02161 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHDQ02161 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHDQ02161 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHDQ02161 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHDQ02161 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHDQ02161 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms