Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DHODHQ02127 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DHODHQ02127 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHODHQ02127 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHODHQ02127 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms