Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2BQ00403 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms