Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFI35P80217 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFI35P80217 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFI35P80217 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFI35P80217 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFI35P80217 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFI35P80217 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFI35P80217 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFI35P80217 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFI35P80217 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFI35P80217 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFI35P80217 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFI35P80217 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IFI35P80217 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFI35P80217 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFI35P80217 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFI35P80217 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFI35P80217 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFI35P80217 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFI35P80217 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFI35P80217 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFI35P80217 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFI35P80217 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFI35P80217 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFI35P80217 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFI35P80217 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFI35P80217 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFI35P80217 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFI35P80217 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFI35P80217 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFI35P80217 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFI35P80217 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFI35P80217 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFI35P80217 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFI35P80217 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFI35P80217 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFI35P80217 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFI35P80217 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFI35P80217 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFI35P80217 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFI35P80217 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFI35P80217 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFI35P80217 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFI35P80217 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFI35P80217 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFI35P80217 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFI35P80217 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFI35P80217 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFI35P80217 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFI35P80217 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFI35P80217 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFI35P80217 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFI35P80217 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFI35P80217 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFI35P80217 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFI35P80217 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFI35P80217 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFI35P80217 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFI35P80217 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFI35P80217 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFI35P80217 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFI35P80217 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFI35P80217 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFI35P80217 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFI35P80217 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFI35P80217 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFI35P80217 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFI35P80217 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFI35P80217 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFI35P80217 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFI35P80217 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFI35P80217 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFI35P80217 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFI35P80217 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFI35P80217 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFI35P80217 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFI35P80217 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFI35P80217 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFI35P80217 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFI35P80217 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms