Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MAP3K9P80192 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MAP3K9P80192 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms