Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSNK2BP67870 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2BP67870 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms