Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO1P63165 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO1P63165 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO1P63165 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO1P63165 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO1P63165 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO1P63165 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO1P63165 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO1P63165 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO1P63165 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SUMO1P63165 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms